истории
Эпидемия коронавируса достигнет пика в середине февраля, он может быть заразнее атипичной пневмонии Что нового узнали ученые за неделю
Источник: Meduza
Новая информация об эпидемии коронавируса 2019-nCoV приходит буквально каждый час. Хорошая новость: распространяется не только сама болезнь, но и научные знания о ней. Всего за несколько дней ученые узнали о ней значительно больше. Рассказываем, что именно.
Что было известно неделю назад
- 2019-nCoV — это РНК-содержащий вирус, очень похожий на возбудителя ТОРС/SARS — тяжелого острого респираторного синдрома, вспышка которого впервые была зарегистрирована в 2002 году также в Китае.
- Первый чистый образец вируса был выделен 7 января, а 12 января его геном был прочитан и опубликован китайскими специалистами в международной базе Genbank. Это позволило оперативно разработать лабораторный метод диагностики вируса на основе ПЦР.
- На данный момент выделено и опубликовано несколько десятков (сейчас — 39, число постоянно меняется) полных геномов вариантов возбудителя, которые выделили у разных пациентов в разных странах мира. Все варианты очень похожи, и большинство специалистов интерпретирует их как свидетельство того, что заражение человека было единичным событием и обмена вирусами между животными и людьми не происходит.
- Больше всего вирус напоминает SARS-подобные вирусы летучих мышей: по текущим оценкам, сходство между ними достигает 98% — именно такая доля «букв» в геномах вирусов совпадают. Некоторые гены совпадают полностью, структура генома также очень схожа с вирусами летучих мышей.
- Вирус точно может передаваться от человека к человеку, однако насколько легко это происходит, до сих пор не ясно — и это один из самых важных вопросов на сегодняшний день. Первоначально власти Китая говорили об ограниченном потенциале заражения: заражались только члены семей уже зараженных или медицинские работники. После этого появились свидетельства передачи от человека к человеку за пределами Китая.
Что нового стало ясно за неделю
- Новый вирус и возбудитель ТОРС/SARS имеют сходный механизм заражения — уже подтвердилась первоначальная догадка о том, что коронавирус использует те же «ворота» для входа в клетку (белок ACE2)
- Шип (он же S-белок), с помощью которого вирус соединяется с клетками хозяина, несет следы положительного отбора, то есть направленно изменяется со временем. Это может свидетельствовать о том, что вирус приспосабливается к новому хозяину, а может быть просто знаком процесса коэволюции — когда старый хозяин меняется вместе с вирусом.
- Новый коронавирус, возможно, более заразен, чем SARS-CoV. Это следует из моделирования динамики распространения инфекции, которую независимо провели несколько групп. Полученные оценки R₀ (это число отражает ожидаемое количество заболевших в уязвимой популяции, когда туда попадает зараженный человек) сейчас сильно разнятся — они суммированы, например, здесь. Первые работы предполагали, что один человек в среднем заразит 3–5 других людей, в последующих статьях оценки стали немного меньше: 2,2—2,9 человека. Эти оценки примерно соответствуют контагиозности ТОРС, однако 2019-nCoV может быть заразен до проявления симптомов, что отличает новый вирус от старого и может сильно повлиять на его распространение. В связи с этим ученые подчеркивают особенную важность ранней диагностики в борьбе с нынешней эпидемией.
- Модели эпидемии, которые строятся сейчас специалистами на основе имеющихся данных о появлении заболевших, позволяют оценить начало инфекции и общее число заболевших. Предполагается, что эпидемия достигнет пика в середине февраля, а общее число заболевших в 2–3 раза превысит число заболевших ТОРС/SARS 18 лет назад. В другой подобной работе ученые утверждают, что инфекция, судя по всему, стартовала около 17 декабря (что совпадает с информацией о первом пациенте), однако контагиозность сильно менялась со временем — это изменение может отражать влияние мер сдерживания, которые организуют власти Китая.
- В сети и СМИ встречаются противоположные оценки тех серьезных мер, которые предприняло китайское правительство для сдерживания эпидемии. Его, например, обвиняют в излишней секретности и слишком медленной реакции на раннем этапе эпидемии. Однако в научной литературе (по крайней мере пока) превалирует положительная оценка и карантина зараженных городов, и информационной открытости — в таком духе выступила, например, редакция авторитетного медицинского журнала Lancet.
- Появились первые полноценные клинические описания заболевания. 29 января вышла статья, где описано течение болезни у 99 пациентов из города Ухань. Половина из них была работниками либо посетителями того самого рынка, с которого началось распространение инфекции. В большинстве случаев болезнь сопровождалась кашлем, высокой температурой и легочной недостаточностью, у трех четвертей заболевших развилась двусторонняя пневмония. В подтверждение того, что сообщалось ранее, медики отмечают, что заболевание затрагивает прежде всего пожилых людей и тех, у кого есть сопутствующие заболевания.
- Австралийские ученые вырастили вирус в культуре клеток человека — впервые за пределами Китая. При этом в самом Китае чистые образцы 2019-nCoV имеются еще с 7 января. Исследователи из Университета Мельбурна собираются использовать вирус, выделенный из тканей зараженного человека, для разработки лабораторных тест-систем и последующего испытания вакцин.
- Как и возбудитель ТОРС/SARS, новый коронавирус требует для проникновения в клетку не просто взаимодействия вирусных и клеточных белков, но и разрезания S-белка, которое проводит одна из клеточных протеаз. Исследователи из Университета Сычуаня провели скрининг нескольких тысяч известных соединений и обнаружили несколько таких, которые препятствуют процессу слияния и потенциально могут быть использованы для борьбы с вирусом. Среди них антибиотик прулифлоксацин и противовирусный препарат биктегравир.
Что все еще неизвестно
- точный механизм передачи вируса,
- его летальность (для оценки которой необходимо знать число не просто зараженных, но число переболевших),
- скорость, с которой распространяется инфекция,
- возможные варианты лечения.
Где следить за новостями об эпидемии
- Специальная страничка Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ). Здесь публикуют ежедневные сводки по развитию ситуации. Поскольку число зараженных меняется постоянно, конкретные числа в сводках могут быть несколько устаревшими по сравнению с другими источниками.
- Центры по контролю и профилактике заболеваний США (CDC) также ведут специальную страницу, посвященную эпидемии на территории страны.
- Интерактивная карта, которую поддерживает международный исследовательский проект GISAID. Данные собираются из нескольких источников: сообщений ВОЗ, CDC и Национальной комиссии по здравоохранению Китая.
- Агрегатор, собирающий самую последнюю информацию о заболевших, которую публикуют китайские власти и локальные СМИ.
- Страница о коронавирусе на сайте Роспотребнадзора
- Несколько ресурсов для медиков и специалистов: один, два, три, четыре.
Подробнее о том, что было известно раньше
Александр Ершов
Откуда у исследователей вирус?
Вместо 2019-nCoV в скрининге исследователи использовали белок SARS-CoV, который имеет высокое сходство с гомологом из нового коронавируса.